Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm29094F6Q785 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm29094F6Q785 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms