Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN8

Pik3c2b, Phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2bE9QAN8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pik3c2bE9QAN8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pik3c2bE9QAN8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pik3c2bE9QAN8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms