Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Cald1E9QA15 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cald1E9QA15 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms