Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

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Length 1,021 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzd7E9Q9W7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms