Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc74aE9Q9U8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms