Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700024B05RikE9Q6D7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms