Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtproE9Q612 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtproE9Q612 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtproE9Q612 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtproE9Q612 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtproE9Q612 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtproE9Q612 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtproE9Q612 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms