Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
8030474K03RikE9Q4Y8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
8030474K03RikE9Q4Y8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
8030474K03RikE9Q4Y8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms