Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm17727E9Q4V7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm17727E9Q4V7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm17727E9Q4V7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm17727E9Q4V7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm17727E9Q4V7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm17727E9Q4V7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm17727E9Q4V7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm17727E9Q4V7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm17727E9Q4V7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm17727E9Q4V7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gm17727E9Q4V7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17727E9Q4V7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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