Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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