Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2T4

4930523C07Rik, RIKEN cDNA 4930523C07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930523C07RikE9Q2T4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930523C07RikE9Q2T4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
4930523C07RikE9Q2T4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
4930523C07RikE9Q2T4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms