Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcc4E9Q236 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms