Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc171E9Q1U1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc171E9Q1U1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
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