Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp558E9Q1J0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Zfp558E9Q1J0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Zfp558E9Q1J0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Zfp558E9Q1J0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Zfp558E9Q1J0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Zfp558E9Q1J0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Zfp558E9Q1J0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Zfp558E9Q1J0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Zfp558E9Q1J0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Zfp558E9Q1J0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp558E9Q1J0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp558E9Q1J0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms