Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Myo5cE9Q1F5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Myo5cE9Q1F5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Myo5cE9Q1F5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms