Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt78E9Q0F0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt78E9Q0F0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms