Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E430018J23RikE9PZQ8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E430018J23RikE9PZQ8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E430018J23RikE9PZQ8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E430018J23RikE9PZQ8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms