Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm5415E9PXF3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm5415E9PXF3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5415E9PXF3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms