Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm3002E9PW72 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3002E9PW72 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms