Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc144bE9PVZ3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms