Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc17E9PVB5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc17E9PVB5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms