Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc175E9PVB3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc175E9PVB3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.3 ms