Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syde2E9PUP1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Syde2E9PUP1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syde2E9PUP1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms