Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh8D3Z6W3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh8D3Z6W3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh8D3Z6W3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh8D3Z6W3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh8D3Z6W3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh8D3Z6W3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh8D3Z6W3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh8D3Z6W3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rdh8D3Z6W3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rdh8D3Z6W3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rdh8D3Z6W3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rdh8D3Z6W3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh8D3Z6W3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms