Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc6D3YZP9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms