Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx8D3YU81 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx8D3YU81 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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