Protein–RNA interactions for Protein: B9UIU9

Gm17660, Predicted gene, 17660, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17660B9UIU9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17660B9UIU9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17660B9UIU9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17660B9UIU9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17660B9UIU9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17660B9UIU9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17660B9UIU9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17660B9UIU9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17660B9UIU9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17660B9UIU9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17660B9UIU9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17660B9UIU9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17660B9UIU9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17660B9UIU9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17660B9UIU9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17660B9UIU9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17660B9UIU9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17660B9UIU9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17660B9UIU9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17660B9UIU9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17660B9UIU9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms