Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nxpe3B9EKK6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nxpe3B9EKK6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms