Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cttnbp2B9EJA2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cttnbp2B9EJA2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cttnbp2B9EJA2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cttnbp2B9EJA2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cttnbp2B9EJA2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cttnbp2B9EJA2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
Cttnbp2B9EJA2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Cttnbp2B9EJA2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cttnbp2B9EJA2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms