Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20547B8JJN0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20547B8JJN0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms