Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apol6B7ZC55 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 217.6 ms