Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnldc1B2RXZ1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms