Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Polr3aB2RXC6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms