Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trappc11B2RXC1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms