Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah3B2RWG3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms