Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clrn2B2RVW2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms