Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud7bB2RUR8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otud7bB2RUR8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otud7bB2RUR8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otud7bB2RUR8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otud7bB2RUR8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otud7bB2RUR8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otud7bB2RUR8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms