Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf3B2RQG2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms