Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU2

Plekhd1, Pleckstrin homology domain-containing family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhd1B2RPU2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Plekhd1B2RPU2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Plekhd1B2RPU2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Plekhd1B2RPU2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Plekhd1B2RPU2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Plekhd1B2RPU2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Plekhd1B2RPU2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Plekhd1B2RPU2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Plekhd1B2RPU2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Plekhd1B2RPU2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Plekhd1B2RPU2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Plekhd1B2RPU2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Plekhd1B2RPU2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Plekhd1B2RPU2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Plekhd1B2RPU2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Plekhd1B2RPU2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Plekhd1B2RPU2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms