Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mbd5B1AYB6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mbd5B1AYB6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mbd5B1AYB6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mbd5B1AYB6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Mbd5B1AYB6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Mbd5B1AYB6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Mbd5B1AYB6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mbd5B1AYB6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms