Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a6B1AVK5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a6B1AVK5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a6B1AVK5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a6B1AVK5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a6B1AVK5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a6B1AVK5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a6B1AVK5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a6B1AVK5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a6B1AVK5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a6B1AVK5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a6B1AVK5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a6B1AVK5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a6B1AVK5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a6B1AVK5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a6B1AVK5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a6B1AVK5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a6B1AVK5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms