Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm438B1ASB3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms