Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prr29B1ARI9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms