Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skint7A7XV04 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skint7A7XV04 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skint7A7XV04 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Skint7A7XV04 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms