Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Skint5A7XUY5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Skint5A7XUY5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms