Protein–RNA interactions for Protein: A7UAK5

Pfkfb3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-biphosphatase 3 splice variant 2, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfkfb3A7UAK5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pfkfb3A7UAK5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pfkfb3A7UAK5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pfkfb3A7UAK5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pfkfb3A7UAK5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pfkfb3A7UAK5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pfkfb3A7UAK5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pfkfb3A7UAK5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pfkfb3A7UAK5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pfkfb3A7UAK5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pfkfb3A7UAK5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pfkfb3A7UAK5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pfkfb3A7UAK5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pfkfb3A7UAK5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pfkfb3A7UAK5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pfkfb3A7UAK5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pfkfb3A7UAK5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pfkfb3A7UAK5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pfkfb3A7UAK5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pfkfb3A7UAK5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pfkfb3A7UAK5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pfkfb3A7UAK5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms