Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atp2c2A7L9Z8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms