Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prr16A3KMN5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms