Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r232A2RTT5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r232A2RTT5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 556.6 ms