Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms